被廣泛使用的方法
基于Venor®Gem qEP經(jīng)典法試劑盒的qPCR檢測法,目前使用較為廣泛,擁有高特異性、高靈敏度等特點(diǎn),還可以選配支原體和細(xì)菌DNA、支原體絕對定量標(biāo)準(zhǔn)品,來進(jìn)行特異性驗(yàn)證、定量檢測。
經(jīng)典法pro版
基于Venor®Gem qOneStep一步法試劑盒的qPCR檢測法,是經(jīng)典法的升級版本,包含經(jīng)典法所有優(yōu)點(diǎn)。另外,內(nèi)控已配置好,更加省時(shí)省力。
傳統(tǒng)認(rèn)為的金標(biāo)準(zhǔn)
分離培養(yǎng)法被認(rèn)為是支原體檢測的金標(biāo)準(zhǔn),準(zhǔn)確率比較高,但培養(yǎng)周期長,而且對于一些特定支原體無法培養(yǎng)。
操作步驟多但簡單
DNA染色法檢測支原體雖然操作步驟較多,包含指示細(xì)胞培養(yǎng),上清液共培養(yǎng)、染色等多個(gè)過程,但并不復(fù)雜,對技術(shù)要求相對沒有那么高。
今天我們就來介紹最后兩種常見檢測法
ELISA法和PCR法
廢話不多說
我們直接上干貨
ELISA法
首先我們先來簡單了解一下ELISA:
酶聯(lián)免疫吸附測定(enzyme linked immunosorbent assay,簡寫ELISA或ELASA)指將可溶性的抗原或抗體結(jié)合到聚苯乙烯等固相載體上,利用抗原抗體特異性結(jié)合進(jìn)行免疫反應(yīng)的定性和定量檢測方法。根據(jù)免疫吸附劑、酶聯(lián)物、結(jié)合物這些試劑的來源、樣本情況,檢測具體條件,可以分為夾心法、競爭法、間接法等不同類型。
支原體檢測過程中用到的ELISA,一般采用的是夾心法,針對支原體16S rRNA基因的帶標(biāo)記探針或抗體,來檢測培養(yǎng)物中是否含有支原體。
先用純化過的支原體抗體包被微孔板,制成固相抗體。
往微孔板中依次加入支原體(Mycoplasmal),再與 HRP(一種雙功能試劑,通過其醛基分別與酶和免疫球蛋白上的氨基共價(jià)結(jié)合,形成酶-戊二醛-免疫球蛋白結(jié)合物)標(biāo)記的支原體抗體結(jié)合,形成抗體 -抗原-酶標(biāo)抗體復(fù)合物。
經(jīng)過*洗滌后加底物 TMB顯色。TMB在 HRP酶的催化下轉(zhuǎn)化成藍(lán)色,并在酸的作用下轉(zhuǎn)化成黃色。
最后用酶標(biāo)儀分析結(jié)果:
顏色的深淺和樣品中的支原體( Mycoplasmal)呈正相關(guān)。用酶標(biāo)儀在 450nm波長下測定吸光度( OD值),通過標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算樣品中支原體濃度。整個(gè)過程時(shí)間比較短,一般三四個(gè)小時(shí)就能出結(jié)果。
整個(gè)過程除取樣外,還包括標(biāo)準(zhǔn)品稀釋、加樣、溫育、配液、洗滌、加酶、溫育、洗滌、顯色、終止、結(jié)果分析,步驟比較多,且很多步驟都需要有一定經(jīng)驗(yàn)的人操作才能保證準(zhǔn)確性,因此對技術(shù)要求比較高。
另外,由于依賴抗體的特性,該方法能夠檢測的支原體種類比較有限,對于沒有抗體的支原體,ELISA就無能為力了。
PCR法
常規(guī)PCR法:
根據(jù)支原體核糖體16s-23s rRNA的特異保守序列設(shè)計(jì)引物,對待檢樣本DNA進(jìn)行擴(kuò)增,通過對擴(kuò)增產(chǎn)物的大小分析作出判斷。
以Venor®Gem OneStep支原體常規(guī)PCR檢測試劑盒為例,簡單介紹一下實(shí)驗(yàn)流程。
樣本處理
與qPCR類似
取適量待檢測樣品上清
95℃孵育10min
以對樣品進(jìn)行穩(wěn)定化處理
試劑制備
離心?按比例混合?靜置?混勻
PCR體系建立
設(shè)置好陰性對照、陽性對照、重復(fù)孔
扣緊蓋子混勻
啟動(dòng)PCR反應(yīng)
根據(jù)使用說明設(shè)置好程序
電泳結(jié)果分析
191bp為內(nèi)控對照條帶,表明PCR反應(yīng)正常。
當(dāng)樣本存在支原體污染時(shí),由于內(nèi)控對照與支原體DNA存在競爭,內(nèi)控對照條帶變?nèi)酰ɡ缰гwDNA>1000拷貝)。
陽性對照中支原體DNA>10000拷貝,內(nèi)控對照條帶會*消失。
可能在80-90bp存在引物自退火形成的條帶,此條帶不影響檢測結(jié)果。
如果待測樣本對PCR產(chǎn)生抑制,則內(nèi)控對照條帶變?nèi)酰ê完幮詫φ障啾龋?,此時(shí)應(yīng)先進(jìn)行DNA抽提(推薦使用:Venor® Gem Sample Preparation Kit 支原體DNA抽提試劑盒),然后再檢測。
常規(guī)PCR的優(yōu)點(diǎn)就是檢測時(shí)間短:2-3小時(shí)即可出結(jié)果、靈敏度高、特異性強(qiáng)、操作簡單。
缺點(diǎn)也很明顯,用PCR檢測已經(jīng)進(jìn)行過支原體滅活的樣品時(shí),由于支原體DNA依然存在,所以此時(shí)PCR結(jié)果仍為陽性,說明該樣品曾經(jīng)感染過支原體。
另外不同廠家的試劑盒差異比較大,需要謹(jǐn)慎選擇。
ELISA法
至此,幾種常規(guī)的檢測方法都已經(jīng)介紹給大家啦,給大家做了個(gè)小總結(jié),供參考。有些單一的檢測方法并不嚴(yán)謹(jǐn),需要結(jié)合實(shí)驗(yàn)情況,聯(lián)合使用多種方法進(jìn)行檢驗(yàn),確保結(jié)果的可信度。
培養(yǎng)法是金標(biāo)準(zhǔn),但是周期長,有些支原體還檢測不到;
染色法普適性強(qiáng),操作簡單,但是對于支原體數(shù)量有要求,也容易有假陽性假陰性;
ELISA法耗時(shí)短,但是對操作人員要求比較高,需要獲得相應(yīng)抗體才可以進(jìn)行試驗(yàn);
常規(guī)PCR法,基本包含了上面所有的優(yōu)點(diǎn),但是不能分辨支原體的死活,用到的試劑盒也是良莠不齊;
qPCR法,涵蓋上述所有優(yōu)點(diǎn),但是對實(shí)驗(yàn)人員有一定的經(jīng)驗(yàn)要求,因此該方法目前也是十分常用的檢測手段。
不同的是,“一步法"試劑盒中,直接將內(nèi)控添加到預(yù)混液中,使用起來更加方便、節(jié)省時(shí)間。
下面我們就來詳細(xì)介紹一下VenorGeM® OneStep支原體檢測試劑盒。
使用方法
步驟
與經(jīng)典法大致相同:
樣品處理?試劑制備?體系建立?啟動(dòng)PCR反應(yīng)?結(jié)果判定
樣品處理:
取100μl左右的細(xì)胞上清液
95℃孵育后離心,取適量用于后續(xù)qPCR。
細(xì)胞培養(yǎng)樣品易含豐富的DNA酶,在低溫下也能降解支原體DNA。因而推薦進(jìn)行樣品穩(wěn)定化處理。
試劑制備:
將緩沖液、預(yù)混液、陽性對照等試劑按照說明書要求,該離心的離心、該混合的混合,處理好后扣緊蓋子備用。
PCR體系建立:
在PCR管中,根據(jù)需要,加入樣品、陽性對照、新鮮培養(yǎng)基(陰性對照),并且設(shè)置好重復(fù)孔,蓋好蓋子,震蕩混勻。
啟動(dòng)PCR反應(yīng):
按照所需參數(shù),設(shè)置好PCR儀,啟動(dòng)程序(具體參數(shù)詳見產(chǎn)品使用說明或是締一生物網(wǎng)站,點(diǎn)擊下方閱讀原文即可)。